第一，矿山环境治理恢复保证金制度适用范围不够宽。目前全国多数省已经建立矿山环境治理恢复保证金制度，均规定保证金只适用于新建矿山企业，或新矿山开发新产生的破坏。而对于历史遗留的矿山环境治理与生态恢复成本仍然纳入保证金的范畴。第二，现行矿产资源补偿费没有体现生态环境补偿的政策含义。
废弃物处理也是矿山生态修复中不可忽视的一环。矿山开采过程中产生的废弃物（如尾矿、废石等）需要得到妥善处置。这包括建设符合环保标准的废弃物堆放场，以及采用先进的废弃物处理技术（如资源回收、无害化填埋等）来减少废弃物对环境的负面影响。
矿山废弃地的生态恢复，只是土壤、植被的恢复是不够的，还需要恢复废弃地的微生物群落。微生物群落的恢复不仅要恢复该地区原有的群落，还要接种其他微生物，以除去或减少污染物。同时，为植物的生长提供营养物质，比如说固氮、固磷，改善微环境。
根据国土部门测算，治理一亩矿山需要1万-2万元的资金投入。这意味着“十三五”期间的矿山土地复垦和生态修复的资金近1000亿。根据中国地质调查局2016年度《全国矿山地质环境调查报告》统计，全国矿山总面积1040公顷（ 56亿亩 ），采矿损毁土地面积300多万公顷（4500多万亩）。
矿山调查：这一阶段涉及对生态系统的结构、功能、水资源、水土流失、盐碱化、野生动植物现状以及人文和生态地理环境等进行全面调查。调查内容包括地形、气候、土壤类型、岩石结构、植物群落等自然因素，以确保修复方案的科学性和准确性。 生态恢复：生态恢复是治理方案的关键部分。
1、矿山地貌修复 矿山开采会改变地貌，破坏原有的地貌景观，因此矿山地貌修复也是矿山生态修复的重要方面之一。矿山地貌修复的主要目标是恢复矿山区域的地貌景观，使其与周边环境相协调。实施办法包括：地貌恢复、景观设计、生态景观建设等。
2、首先，人为干扰造成的破坏难以恢复。在矿山采矿活动中，大量的土壤、岩石等自然资源会被破坏甚至浪费。这些大量的破坏和浪费造成了无法估量的生态破坏和环境污染，有些甚至无法恢复。其次，缺乏技术和资金支持成为矿山生态恢复的难点。
3、中国地质调查局航遥中心的调查结果则显示，截至2014年，中国废弃矿山面积为仍需治理矿山面积的5倍，废弃矿山的治理力度有待加强。从这些公开数据可以看出，中国的矿山生态修复形势依然严峻。
矿山地貌修复 矿山开采会改变地貌，破坏原有的地貌景观，因此矿山地貌修复也是矿山生态修复的重要方面之一。矿山地貌修复的主要目标是恢复矿山区域的地貌景观，使其与周边环境相协调。实施办法包括：地貌恢复、景观设计、生态景观建设等。
矿山土地修复 矿山土地修复是矿区生态修复的重要块，包括矿区环境污染的治理、矿区环境影响的评价、矿区的生物多样性保护和恢复等。矿区造林、植草、复绿等是常用的方法。
水体治理也是矿山生态修复的关键部分。矿山开采会产生大量含有重金属和其他有害物质的废水。如果未经处理直接排放，将对周边环境造成严重影响。因此，建立有效的废水处理系统至关重要。这包括建设沉淀池、过滤装置和污水处理设施，以确保废水在排放前达到环保标准。
矿山生态修复主要包括土壤修复、水体修复、植被恢复和生物多样性保护等方面。首先，土壤修复是矿山生态修复中的关键环节。由于长期的开采活动，矿山土壤往往受到重金属污染、酸碱度失衡等问题。为了恢复土壤健康，需要采用物理、化学或生物方法来去除或固定土壤中的有害物质，如重金属离子。
矿山生产过后，对于整体环境破坏较为严重，矿山生态修复主要包括治理因矿山开采引起的水土流失、土壤污染、山体滑坡、植被退化等，通过治理修复还原未遭到破坏前的状态，实现环境自然和谐。如：矿山修复、边坡修复、生态复垦、矿山废弃地治理、矿区水污染治理、土壤治理、尾矿治理等。
矿山生态修复方案包括以下几个关键方面： 土地复垦：矿山开采常常导致土地严重破坏和植被丧失。通过实施土地复垦，如疏通河道、植树造林等措施，可以使废弃的矿山土地恢复生机，转变为可供利用的水源地、农田或林地，从而为生态环境和资源提供支持。
废弃物处理也是矿山生态修复中不可忽视的一环。矿山开采过程中产生的废弃物（如尾矿、废石等）需要得到妥善处置。这包括建设符合环保标准的废弃物堆放场，以及采用先进的废弃物处理技术（如资源回收、无害化填埋等）来减少废弃物对环境的负面影响。
第四，矿山环境治理与生态恢复中央专项资金资助范围有限，资金总量小，地方配套困难。当前，中央矿山环境治理的专项资金来源主要是矿产资源补偿费和矿权使用费与价款，但是中央下达的专项资金估计只占三项收费收入的10%-20%，占矿山历史所创利税的1%，可见总体投资量不大。
总之，矿山治理采用的定额主要包括矿山环境治理定额和矿山生态修复定额，这些定额在规范矿山治理工程、保证工程质量以及合理控制工程成本等方面具有重要作用。
矿山生态修复方案包括以下几个关键方面： 土地复垦：矿山开采常常导致土地严重破坏和植被丧失。通过实施土地复垦，如疏通河道、植树造林等措施，可以使废弃的矿山土地恢复生机，转变为可供利用的水源地、农田或林地，从而为生态环境和资源提供支持。
矿山重金属污染的植物修复 重金属耐性植物不仅能耐重金属毒性，还可以适应废弃地的极端贫瘠、土壤结构不良等恶劣环境，部分耐性植物还能富集高浓度的重金属，因而被广泛地用于重金属污染土地的修复。
国内矿山修复如寻乌县废弃矿山，采用“生态+”模式，实现了山水治理与经济发展的融合；绿金湖项目则通过PPP模式，治理沉陷区并打造城市中央公园。黄石国家矿山公园和上海天马山世茂深坑酒店则利用废弃地，创新建筑与自然的融合。辰山植物园和东湖风景区则通过生态修复，将废弃采石场变为生态游览胜地。
